Para ocultar la parte negra de la capa de arriba, ve al menú Capa->Estilos de Capa ->Opciones de fusión.
Se deplegará una ventana como esta:
Desplaza la flechita de la izquierda hacia la derecha, hasta que el fondo negro desaparezca. Luego, aprieta Alt mientras separas las dos mitades de la flechita para que la transición entre lo que se ve y lo que se oculta sea un poco más suave.